比如两个不同宇宙之间，氢键的属性存在细微差别，这会导致其他宇宙的水分子属性与零号宇宙水分子属性不同。这中差别扩散开来，所有元素、所有原子、所有分子、所有化学反应都存在差别。
在这种情况下人类如果进行跨宇宙殖民，目标宇宙的物质就会与构成人类身体的零号宇宙物质形成不兼容。比如人类在目标宇宙喝一口水，这一口水对人类来说，可能跟毒药差不多，会从原子级别上导致人体构成物质的崩溃。
物质的不兼容是跨宇宙殖民的最大障碍，现在科学院必须解决这个问题，否则人类永远别想离开零号宇宙的依附关系。这个问题不解决，人类就无法脱离对零号宇宙的物质依赖，即使移民了，分支种族也需要定期从零号宇宙获得物质补充，否则他们早晚会死于元素冲突。
这种殖民，实际上就像是体外的胎儿一样，分支种族必须有一个脐带与零号宇宙相连，时刻获得零号宇宙的滋养。一旦出现外力导致的干扰和突变，让这种脐带供养方式中断的话，这个分支种族就会被困死在殖民宇宙里。
这种方式实在太危险，所以在科学院没有解决这个问题之前，人类是无法进行大规模跨宇宙殖民的。
宇宙之间物理规则的改变是存在很明显特征的，以人类生存的零号宇宙基准点，物理规则将会随着编号的变化，分别向正向和负向发展。这种变化是渐变的，两个相邻宇宙之间的差别是非常微小的。
以零号宇宙和一号宇宙为例，两者之间只存在非常小的差异，各种元素特性基本相同。科学院觉得在元素之间差异很小的情况下，生物体很可能能够自然适应。
为了证明这个观点，科学院进行了大规模活体实验，而实验的样本就是巴昆的那三支移民舰队。这三支殖民舰队，实际上是被人类骗过去的，它们在茫然无知的情况下，被分别投入到相邻的平行宇宙中。
殖民舰队抵达之后，科学院就在高维宇宙密切关注着这三支舰队的发展情况。
初来乍道的巴昆舰队一切都很新鲜，他们按照殖民之前指定的计划，占据一个生命星系，开始探索周围的星域，开始逐步的选择目标，控制新的附庸种族。在巴昆的五级文明面前，附庸种族的抓捕和逼降计划非常顺利。
三支舰队很快建立起一个势力雏形，这些势力都是沿用巴昆帝国已有的架构。三支舰队初步站稳脚跟之后，开始自身种群的繁殖，并且慢慢将影响力向周围星域扩散。
在这个过程中，三支舰队先后发现了一些奇怪的差异，他们在偶然的情况下，发现了物理常量的不同。在这个新的星域，各种物理常量与理论值存在细微的偏差。这个发现一度让它们感觉很困惑，并且一直没能找到原因，久而久之这事就被放在了一边。
科学院注意到，这三支舰队都能很好的适应目标宇宙的物质环境，它们身体内开始进行自然的物质代谢。只需要几个月的时间，他们就能够完成物质代谢，它们开始从物质层面上，变成目标宇宙的生物。
在这个过程中，并没有发生太大的意外，科学院认真比较了三个目标宇宙与零号宇宙物质的不同，结果发现，当元素的差异小于一定值的时候，生物体是能够自然进行物质替换的。
按照这个观点，科学院开始用奴隶进行活体实验，看看差距大到什么程度的时候，会出现元素冲突。
经过大量实验，科学院发现，当宇宙的编号差距小于五十的时候，生物体一般能够成功实现物质替换，中间不会发生生命危险。但是当编号大于五十之后，这种物质替换就会充满危险，生物成功替换的几率直线下降。
从这个意义上来说，人类现在能够直接在正五十号和负五十号之间的宇宙进行殖民，并且在殖民的过程中，可以放心的使用目标宇宙的元素，不会出现太大的元素冲突问题。但是编号更大的平行宇宙就不行了，人类将会出现明显的元素冲突。
虽然有将近一百个平行宇宙可以使用，暂时来看足够用了，但是科学院明显不打算到此为止，科学院开始进行更深入的研究，准备让人类能够实现大跨度的殖民。
科学院觉得，在大跨度下进行殖民，元素冲突问题主要有两个解决思路。一个是渐变方案，渐变就是让人体以五十个编号为单位，进行连续多次的物质替换。人体在新陈代谢中始终与周围环境进行物质代谢，这种代谢会循序渐进的逐步将人体的所有物质全部更新。
而人类如果想要进行大跨度殖民，就必须通过若干次这种物质更新，降低大的跨度变小，小步快跑的实现物质循环更替。
不过这种渐变方案貌似说得通，实际上它还是有一些问题需要克服，其中一个比较关键的问题在于，人体并不是所有细胞和所有物质都会进行更替的。比如人体的神经细胞，可能会更随人类一辈子。
而这些神经细胞内部的DNA分子，肯定也会一直陪伴着人类，所以这种渐变模式，就必须克服这个问题，将这些根本不会更新的细胞和物质想法替换掉。
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